俗话说“金无足赤，人无完人”，作为阻燃剂的红磷，也存在许多缺点，主要表现在以下六个方面：

1、基材腐蚀

红磷可以作为干燥剂使用，有较强的吸水性，吸水之后生成H3PO2、H3PO3、 H3PO4等物质，此时，红磷因粘度增加而失去流动性，吸水产生的磷酸属于更易吸水的物质，以至于最后变成稀泥状物质。所以，当红磷添加到高分子材料中，随着时间的推移，在材料表层的红磷会因吸潮氧化而使制品表面被腐蚀，进而失去光泽和原有的一些性能，更为严重的是，这种腐蚀会慢慢向材料内层扩展。

2、难以相容

无机有机素来难以相容，作为无机物的红磷与有机树脂相容性自然不好，不仅难以分散，而且会出现离析沉降，使树脂的粘度上升，这对树脂的后续处理和使用（浇注、浸渍、挤压等）带来许多不便，严重时，会导致材料的性能下降。

3、污染环境

物质的性质稳定，一般是相对的（哲学层面上讲，稳定是相对的，不稳定是绝对的），因此，当红磷长期与空气接触时，会发生缓慢化学反应，在生成磷的含氧酸同时，还将放出剧毒PH3气体，从而对环境造成污染。并且用红磷阻燃的热塑性弹性体味道相对溴系阻燃、磷系-氮系配合阻燃的气味更大。

4、应用限制

由于红磷的吸湿性和不稳定性，当其添加到塑料制品中时，会影响制品的物理性能，尤其对弱电元件的漏电性和高压元件的绝缘性影响更大，从而限制了红磷在电元件领域的阻燃应用。

5、燃烧爆炸

虽然红磷可以作为阻燃剂使用，但是它本身是可燃的，特别是当红磷受到冲击时，更易被引燃，因此，干燥的红磷粉尘具有燃烧及爆炸危险，在我国也被列为危险化学品。

6、着色基材

与其它白色阻燃物质相比，红磷的深紫红色易使被阻燃的制品着色，导致生产的制品颜色难以控制或者是增加了颜色调配的成本。